吳清基,臺南縣佳里鎮人,國立臺灣師範大學教育博士,曾擔任教育部技職司長、常務次長、政務次長、臺北市副市長等職,現任教育部部長、臺灣師範大學教育系兼任教授。
2001年曾代表中國國民黨與民主進步黨提名的蘇煥智競選台南縣縣長,結果以44.5%的得票率落敗。
在馬英九臺北市長任內擔任教育局長,外界大多視吳為馬團隊的一員。2006年郝龍斌當選市長,吳留任於市府,並在台北市「一綱一本」、「共辦基測」政策中扮演重要角色。